不严谨的加工肉类导致李斯特菌感染
南非爆发的李斯特菌感染与加工肉类有关,这一结果由南非国家卫生实验局Juno Thomas研究组取得。2020年2月13日出版的《新英格兰医学杂志》发表了这项成果。
研究组进行了流行病学、回溯和环境调查,并采用全基因组测序对单核细胞增生李斯特菌分离株进行了分型。2017年6月11日至2018年4月7日,实验室确认1例单核细胞增生李斯特菌感染。
共发现937例感染,其中728名患者中有193名(27%)死亡。对609例患者的临床分离株进行了测序,567例(93%)被鉴定为6型序列(ST6)。在病例对照分析中,与非ST6感染者相比,ST6感染者中有很多人食用了香肠,优势比为8.55。
香肠和环境样本也分离出了ST6菌株,这些菌株与患者的菌株属于同一核心基因组多位点序列分型簇,差异不超过4个等位基因;这些发现表明,在某个工厂生产的香肠是疫情源头。从该工厂召回香肠后,单核细胞增生李斯特菌ST6感染率迅速下降。
综上,全基因组测序有助于发现疫情,指导回溯调查,从而锁定源头。
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