为加强全省食品安全风险监测，全面掌握和分析食品安全风险隐患，省卫生计生委联合食药监、农业、出入境检验检疫、粮食等部门，结合云南实际，将消费量大、涉及人群多、具有云南地方特色食品纳入省级监测内容并逐年扩大食品监测覆盖面。2015年，食品中化学污染物和有害因素监测、食品微生物及致病因子监测点覆盖16个州市、112个县、区，州、市级覆盖率100%，县级覆盖率86.8%；设立食源性疾病哨点监测医院138家，食源性疾病（包括食物中毒）监测覆盖率100%。完成化学污染物及有害因素监测3303件，完成微生物及致病因子监测3498件，完成粮食、奶粉和蔬菜（鲜茶叶）三类食品39件样品放射性污染监测。
全省通过“食源性疾病暴发报告系统”报告食源性疾病事件544起，发病3872人，死亡43人；138家哨点医院通过“食源性疾病监测报告系统”报告病例15976例，完成病例病原学检验1837例，无疑似食源性异常病例/异常健康事件报告。全年未监测到污染严重的食品，未发生食品恶性污染事件，无重大及特别重大食品安全事故报告，全省食品安全总体形势平稳。
