报告显示，据经营环节重点水产品质量安全结果显示，经营环节重点水产品的抽检合格率为91.5%，其中桂鱼不合格批次占比最高，为43.47%，黑鱼占23.18%。检出孔雀石绿是经营环节水产品不合格的主要原因，占不合格批次的66.67%。硝基呋喃代谢物检出占比30.43%，氯霉素检出占4.35%。
而在上游的养殖捕捞环节，农兽药残留超标、环境污染引发的质量安全问题、微生物污染、寄生虫感染与含有有毒有害物质是这个环节水产品质量安全的主要风险。
在加工制造环节，根据国家食药监总局数据，我国水产品及制品2016年的抽检合格率为95.7%，但合格率在我国32类主要食品种类中仅位列第23位。据介绍，加工制造环节水产品质量安全的主要风险包括菌落总数超标、大肠菌群超标、挥发性盐基氮超标、检出亚硫酸盐等，其中菌落总数超标和大肠菌群超标所占的比例为64.29%，微生物污染成为水产品及制品质量安全不合格的最主要原因。
