一、 修正第八条：
（一）为加强对食品业者的管理，明确规范经“中央”主管机关公告类别及规模的食品业者，应就其卫生安全管理系统，主动接受第三方验证的外部查核监控，故增列第八条第五项的规定。
（二）同法第六项，验证应由“中央”主管机关认证的验证机构办理，有关申请、撤销与废止认证的条件或事由，执行验证的收费、程序、方式及其他相关事项的管理办法，由“中央”主管机关制定；以建置符合国际规范的第三方认验证制度，提升二级品管制度的独立性、公正性，强化验证效力。
二、 修正第四十八条：
因应第八条修正，为提升第三方验证制度的管理效能，增订违反第八条第五项规定的罚则，经命限期改正，届期不改正者，处新台币3万元以上300万元以下罚款；情节重大者，并可命其歇业、停业的规定。
三、 修正第二十五条：
（一）针对直接供应饮食场所及散装食品，增列“及其他应标示事项”。相关应标示事项预计半年内公告。
（二）增列“境内通过农产品生产验证者应标示可追溯的来源；有‘中央’农业主管机关公告的生产系统者，应标示生产系统”，农产品将依规定标示来源牧场及生产系统。
