《办法》对食品药品抽验管理的原则与程序，抽验计划与抽样、检验，检验结果处理和样品处置，资金管理和组织保障等作出相应规定。《办法》明确，食品药品抽验管理应当遵循科学公正、抽检分离、注重绩效的原则，严格按照制定抽检计划、组织抽样、安全检验、结果上报、结果公布、样品管理和绩效考核等程序进行，抽验工作流程要公开透明，实行样品抽样与技术检验相分离，抽检结果按规定时限及时向社会公开。同时规定，除药品、医疗器械外，抽取食品、保健食品和化妆品样品应当支付费用。
《办法》还明确了抽样人员的人数、检验结果的通报、异议处理以及不合格样品的处理等内容。
