为确保进口屠宰马卫生安全、防止国外动物疫情传入我国，该局收集蒙古国马匹疫情疫病资料，加强与蒙古国检疫部门和东乌旗地方农牧部门间信息交流，及时为企业做好疫情咨询服务，帮助企业实时了解蒙古国动物疫情，减少企业进口风险，预防动物疫情传入扩散。目前东乌珠穆沁已有3家企业从蒙古国进口屠宰马。
另一方面，为使企业缩短通关时间，该局打破固有货车入境手续办理模式，专门为入境蒙古马开通“随到随验”绿色通道，经过现场数目清点、相关单证核对和对交通工具实施消毒等查验，第一时间为载马车辆办理检验检疫手续，为企业节省时间，降低运营成本。
此外，为确保进口活畜质量安全，帮助企业规范并完善临时隔离检疫场和屠宰厂管理，组织检验检疫人员专门研究标准化隔离场设计布局，指导企业按照标准选址和建设。隔离期间，对饲草、饲料进行必要熏蒸处理，对运输工具和其他物品进行严格消毒，确保无传染病、无寄生虫病等临床症状后进行屠宰加工。在此基础上，指导屠宰厂对屠宰、分割、包装冷冻等车间进行全面升级改造，确保马匹健康无病后销售。
